食品经营许可证主要是针对销售已经包装好的食品的公司办理的，餐饮服务许可证则是针对有实际经营场所的店铺办理的，虽然这两个证已经合二为一，但是主体业态还是不同的，办理要求自然也是不同的。
新办食品经营许可证，首先需要提出现场核验申请，经过现场验收之后，凭借现场验收核查意见和其他的申请材料在意见出具之日起20个工作日内申请办理，如果超期就要重新进行现场验收。如果只是申请预包装食品销售(含冷藏冷冻食品、不含冷藏冷冻食品)、网上销售食品、自动售货机销售食品，这些可以免除现场验收，可以直接申请。
1、申请现场验收程序如下：申请人提出现场验收------部门到现场核查------根据现场核查情况出具现场验收核查意见
2、通过现场核查之后，可申请办理食品经营许可证，程序如下：提交材料----部门受理----审批材料----发放食品经营许可证。
申请食品经营许可证条件：
1、食品经营许可证申请的主体想要申请食品经营许可，首先要取合法的主体资格，比如获得营业执照、法人登记证或社会团体登记证。应营业执照作为申请主体的有企业法人、合伙企业、个人独资企业、个体户、商事主体分支机构等。企事业单位、机关、社会团体、民办非企业单位等申办单位食堂，主要以机关或失业单位法人登记证、社会团体登记证或营业执照等载明的主体为申请人。如果同时供应两个及以上的企业员工就餐的工业区食堂可以承包方名义申请。
2、食品经营许可具体审查条件各类食品经营单位的具体审查标准在《上海市食品经营许可审查标准(试行)》。
3、不能申请食品经营许可的
被吊销经营许可证的食品经营者，连带法定代表人、直接负责的主管人员和其他直接责任人员从处罚决定之日起，5年内不得申请食品经营许可。
以材料或隐瞒实情获得食品经营许可的，申请人在一年内不能再次申请。被许可人以欺骗、贿赂等不当方式获得许可的，被许可人三年内不能再次申请许可。

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